Esta versión en miniatura vuelve a ser un 55% más pequeña que el de la consola original. Además, es una miniconsola aún más compacta que la primera Mega Drive Mini con unas medidas de 120,8 milímetros de ancho, 32,3 de alto y 116,5 de profundidad.
Al comprar Mega Drive Mini 2 se incluye un cable HDMI, otro de alimentación y su mejorado gamepad de 6 botones en lugar del de 3 que acompañaba a la primera Mega Drive Mini. Aquellos que quieran jugar en multijugador local con amigos y familiares, tienen la opción comprar un segundo mando por separado. Por último y como complemento adicional, se pondrá a la venta un kit decorativo que simula la apariencia del soporte Mega CD II, incluyendo el mini disco de Sonic CD y el cartucho de Virtua Racing.